Het gewas radijs moet beschermd worden tegen bodemschimmels of schimmelsporen uit de lucht. Ook tegen kruipende en vliegende insecten moet de radijs beschermd worden. Voordat je middelen inzet tegen de ziekteverwekkers en schadelijke insecten moet je eerst een plan van aanpak maken om de radijs zo te laten groeien, dat ziektekiemen de minste kans maken. Ten eerste wordt de grond goed behandeld met grondverbeteraars, water en bemesting. Hierdoor onstaat er een natuurlijke bodem, die de radijsplantjes een sterke natuurlijke weerstand geeft.

Het klimaat in de kas moet goed worden gevolgd: niet te vochtig en weinig temperatuur schommelingen. De radijs groeit dan regelmatig en zonder stress. Tenslotte controleer je het gewas regelmatig op de gezondheid. Een kleine aantasting kan worden getolereerd, maar die moet wel in de gaten worden gehouden. Indien de plant genoeg weerstand heeft en het klimaat gunstig wordt bijgestuurd, kan de aantasting worden ingedamd. Indien de ziektedruk of aantasting toeneemt dan kan pleksgewijs worden ingegrepen met het weghalen van de zieke plantjes of indien het een groter oppervlakte betreft het toepassen van een speciaal en zorgvuldig ontwikkeld gewasbeschermingsmiddel. Gewasbeschermingsmiddelen worden toegediend door middel van een spuitboom die laag over het gewas werkt en voor een goede verdeling zorgt.

Ziekten die regelmatig in de radijs kunnen voorkomen zijn: Valse meeldauw, Rhizoctonia en fusarium. Plagen die regelmatig in de radijs voorkomen zijn: Vreterij aan de knol door o.a. muizen, emelten, springstaarten, stromijten, larven van diverse insecten, zoals de koolvlieg; vreterij aan het blad door rupsen en mineervlieglarven.